اعضای هیأت امنا بر اساس استقلال دانشگاه و قانون تشکیل هیأت‌های امنای دانشگاه‌ها و مؤسسات آموزش عالی و پژوهشی عبارتند از: وزیر علوم، تحقیقات و فناوری، رئیس دانشگاه، ۴ تا ۶ تن از شخصیت‌های علمی و فرهنگی یا اجتماعی کشور که نقش مؤثری در توسعه و گسترش دانشگاه داشته باشند و رئیس یا نماینده سازمان مدیریت و برنامه‌ریزی.

اهم وظایف و اختیارات هیأت امنا چنین است:

تصویب آئین‌نامه‌های داخلی هیأت امنا، سازمان اداری و تشکیلات دانشگاه و مقررات استخدامی اعضای هیأت علمی، بودجه پیشنهادی، بودجه تفصیلی حساب‌ها و ترازنامه سالانه دانشگاه، نحوه وصول درآمده‌ای اختصاصی و مصرف آن، تعیین و نحوه اداره واحدهای تولیدی، خدماتی، کارگاهی، بهداشتی و درمانی، میزان پرداخت حق‌التحقیق، حق‌التألیف و نظایر آن، پیشنهاد میزان فوق‌العاده‌های اعضای هیأت علمی و غیر هیأت علمی و بررسی گزارش دانشگاه که از طرف ریاست دانشگاه ارائه می‌گردد.

موضوعات پیشنهادی قبل از طرح در هیأت امنا، در کمیسیون دائمی مرکب از رئیس فنی و مهندسی، یک تن از معاونان یا مشاوران وزارت علوم، تحقیقات و فناوری، یک تن از متخصصان و صاحبنظران، نماینده سازمان مدیریت و برنامه ریزی و معاون اداری و مالی فنی و مهندسی موردبررسی کارشناسی و تخصصی قرار می‌گیرد.

اعضای هیات امنا

رئیس هیأت امنا : جناب آقای دکتر منصور غلامی – وزیر محترم تحقیقات و فناوری و رئیس هیأت امنا

و اعضای محترم هیأت امنای دانشگاه صنعتی اصفهان ( به ترتیب حروف الفبا ) :

جناب آقای دکتر هادی اکبرزاده : معاون محترم مرکز الگوی اسلامی- ایرانی پیشرفت و استاد دانشکده فیزیک دانشگاه صنعتی اصفهان

جناب آقای دکتر عبدالرضا باقری : قائم مقام محترم وزیر و رئیس مرکز هیأت‌های امنا و هیأت‌های ممیزه

جناب آقای دکتر بهرام سبحانی : مدیرعامل محترم شرکت فولاد مبارکه اصفهان

جناب آقای دکتر سید مرتضی سقاییان‌نژاد : شهردار محترم قم و استاد دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر دانشگاه صنعتی اصفهان

جناب آقای دکتر مجتبی صدیقی : معاون محترم و رئیس سازمان امور دانشجویان و رئیس کمیسیون دائمی هیأت امنا

جناب آقای دکتر محمدرضا عارف : نماینده محترم مجلس شورای اسلامی و عضو مجمع تشخیص مصلحت نظام

جناب آقای دکتر حمیدرضا فولادگر : نماینده محترم مجلس شورای اسلامی

جناب آقای دکتر غلامرضا گرایی‌نژاد : نماینده محترم سازمان مدیریت و برنامه‌ریزی کشور

جناب آقای دکتر دارا معظمی : رئیس محترم فنی و مهندسی گلپایگان

جناب آقای دکتر محسن مهر علیزاده : استاندار محترم اصفهان